PayU umožňuje několik způsobů napojení podle typu e-shopu a zvoleného technického řešení. Základní verzí je přesměrování na platební bránu (Paywall) – po dokončení objednávky je zákazník přesměrován na zabezpečenou platební stránku PayU, kde provede platbu. Po provedení platby se zákazník vrací zpět na stránky e-shopu, který může podle svých preferencí nastavit stránku s poděkováním nebo dalšími nabídkami.
Dále lze využít transparentní integraci (tzv. embedded), ve které je platební formulář vložen přímo do stránky e-shopu, takže zákazník zůstává po celou dobu na webu obchodu. Transparentní integrace je doporučována pro pokročilejší systémy, ve kterých je třeba spravovat platby, řešit refundace a opakované platby či ověřování transakcí přímo v rámci vlastního rozhraní a interních systémů, a je poskytována na základě individuální žádosti.
Kromě toho PayU nabízí i pluginy pro nejznámější e-shopové platformy, jako je Shopify, WooCommerce, Magento a další. Je možná také integrace vyvinutá přímo pro mobilní aplikace obchodů prostřednictvím mobilního SDK.
